Porque Kakashi não aparece em Boruto?

Os motivos, na verdade, são vários. Kakashi sofreu por muitos anos com os efeitos colaterais de possuir um Sharingan sem ser um Uchiha. Por exemplo, ele não podia “desativá-lo”, o que fazia com que o dojutsu constantemente drenasse seu chakra. É por isso, inclusive, que ele tampava o olho na maior parte do tempo.

Como Kakashi tem Sharingan em Boruto?

Já Obito deu a Kakashi os Sharingan de uma forma espiritual através de seu chakra. Uma vez que esse chakra se dissipou após não ser mais necessário, os poderes foram embora e os olhos de Kakashi voltaram a ser olhos comuns.